自治机构（Autarquias）是由法律创建的公法法人，旨在行使需要专业化的国家职能。其设立由专门法律规定，无需注册。创建自治机构的法律倡议权属于行政首长。
其员工为法定职员，受禁止有偿兼职的规定约束。
享有税收豁免权。
任命负责人的权限属于行政首长；其任职方式依照法律或章程规定。
受招标程序约束。
承担客观责任。
通过行政行为进行组织。
其资产属于公共资产。
法律制度属于公法范畴。
拥有独立的财务能力。
巴西自治机构的例子
具有监管职能的机构：
国家补充健康局 (ANS)
国家电信局 (ANATEL)
国家水路运输局 (ANTAQ)
国家陆路运输局 (ANTT)
国家卫生监督局 (ANVISA)
国家水务局 (ANA)
国家电影局 (ANCINE)
国家石油局 (ANP)
国家民航局 (ANAC)
以及
巴西情报局 (ABIN)
亚马逊发展局 (ADA)
巴西航天局 (AEB)
专业委员会，根据维基百科，它们与协会不同，因为协会是具有不同目的的集合体，而委员会则负责监管和组织专业活动。
联邦图书馆学委员会
联邦生物学委员会
联邦生物医学委员会
联邦会计委员会
联邦房地产经纪人委员会
联邦经济学委员会
联邦体育教育委员会
联邦护理委员会
联邦工程、建筑与农学委员会
联邦统计学委员会
联邦药学委员会
联邦物理治疗与职业治疗委员会
联邦言语治疗委员会
联邦兽医学委员会
联邦医学委员会
联邦博物馆学委员会
联邦营养师委员会
联邦牙科委员会
联邦心理学委员会
联邦化学委员会
联邦社会工作委员会
联邦神学家委员会
联邦商业代表委员会
全国公共关系专业人员委员会
巴西律师协会 (OAB) - 维基百科在此点上是错误的。
并强调，“OAB 与任何公共机构之间不存在隶属或依赖关系”。
来源：MARCUS VINICIUS FURTADO COÊLHO，律师、教授、OAB 联邦委员
巴西音乐家协会
根据维基百科，一些部门被创建为自治机构，但并非巴西政府的所有部门都是如此。联邦警察局是隶属于司法部的机构。
国家抗旱工程部 (DNOCS)
国家矿产生产部 (DNPM)
政治与社会秩序部 (DOPS) - 已撤销
一些研究所：
国家殖民与土地改革研究所 (INCRA)
国家计量、标准化与工业质量研究所 (INMETRO)
国家工业产权研究所 (INPI)
国家教育研究与调查研究所 (INEP)
国家历史与艺术遗产研究所 (IPHAN)
能源与核能研究所 (IPEN/CNEN)
其他自治机构
巴西中央银行 (BACEN)
佩德罗二世学院 (Colégio Pedro II)
国家核能委员会 (CNEN)
国家社会保障研究所 (INSS)
圣保罗和平司法国家整合研究所
和平司法国家整合研究所
巴西地理与统计研究所 (IBGE)
国家计量、标准化与工业质量研究所 http://www.inmetro.gov.br/
国家印第安人基金会 (FUNAI) http://www.funai.gov.br/
巴西环境与可再生自然资源研究所 (IBAMA) http://www.ibama.gov.br/
阿尼西奥·特谢拉国家教育研究与调查研究所
马瑙斯自由贸易区管理局 (SUFRAMA) http://www.suframa.gov.br/
